在东京的教会大学「立明教学园」上学的男主角水村心太,自少便成为孤儿的他,与自己幼驯染槙村千鹤一同上学,过著平凡普通的学园生活。可是某一天,一位罗马尼亚的混血女生岸本莉莉丝却突然转入「立明教学园」并使心太的生活产生了急剧的转变。原来,心太本身不但是一名吸血鬼猎人,而且还是雷莫德一族(就是吸血鬼猎人中最盛名者)的唯一继承者,与身份充满谜团的莉莉丝,两人的命运将使他们作出残酷的选择。
初高中一体,让一岐日和(内田真礼 配音)和山下晶(高山优子 配音)、田端爱美(高桥未奈美 配音)再度成为同班同学。当日和考虑是否要加入料理部时,却被Get新技能的夜斗(神谷浩史 配音)附体,由此性情大变,先是在课堂大大咧咧宣言改变形象,尽展女汉子风范,接着又在走廊、校园内卖弄妩媚,派发联系方式,俨然一副夜店女郎做派。随后更冲上绿茵球场,与校队健儿共同挥洒汗水。倒霉的本尊紧随其后,希望夺回身体,无奈都以失败告终。等到了最后,夜斗更在众目睽睽之下做出了令全校师生大为震惊的壮举来。
日和的高中生活,就以如此混乱的局面开始了……
故事以18世纪的欧洲为舞台,在当时的意大利某小镇上,有着日本血统的孤儿天马和喜爱绘画的亚伦是一对挚友。某日亚伦受到大圣堂的神父 ( 睡神修普诺思) 的指引,去到一处被称为“地面上的极乐净土”的地方寻找“真实之红”。在那里亚伦遇到了一个叫“潘多拉”的神秘少女,自此亚伦的身体开始发生了变化。
另一方面,受到天秤座的黄金圣斗士童虎的引荐,天马决定前往希腊圣域接受圣斗士的训练。在圣域,天马遇到了儿时的玩伴,同时也是亚伦的妹妹萨莎。几年前被人收养的萨莎,原来竟然是女神雅典娜的转世。
2年之后,天马终于成为天马星座的圣斗士。另一方面,受到潘多拉引导的亚伦,体内的冥王哈迪斯的灵魂觉醒,并向圣域发动全面进攻……