高中生加藤胜（小野大辅 配音）和弟弟过着相依为命的生活，某日，加藤胜所在的地铁站遭到了无差别杀人犯的袭击，为了救人，加藤胜身中数刀不幸身亡，而当他再度睁开双眼之时，却发现自己完好无损的站在一个陌生的房间里，眼前是一个黑色的诡异圆球。
　　和加藤胜在一起的，还有下平蕾佳（早见沙织 配音）、西丈一郎（郭智博 配音）和铃木良一（池田秀一 配音）三人，他们和加藤胜一样，都是已死之人。蕾佳告诉满头雾水的加藤胜，黑色的圆球名叫“GANTZ”，而他们所要做的，是等待圆球下达的命令。这一次，四人被传送到了大阪，他们所要面对的，是叫做“滑瓢”的怪物以及一场盛大的百鬼夜行，只有在GANTZ所规定的时间内杀掉所有的怪物，加藤胜才能够得到再次回到弟弟身边的机会。

　　十二岁的神山满月（绪方惠美 配音）和外婆相依为命，酷爱唱歌的她却由于喉部的癌症而被外婆严令禁止歌唱。满月和幼年玩伴英知（木村良平 配音）有着约定，为了完成约定，满月向着成为歌手的道路上努力前进。某一日，一个名为“香葱拉面”的组合出现在了满月的满前，他们自称见习死神拓人（斋藤恭央 配音）和由依（本多知惠子 配音），他们告诉满月，她只剩下一年的寿命，而只要拿到她的灵魂，拓人即可成为正式的死神。伤心的满月感动了由依，他们决定帮助满月在死前达成她最后的心愿。
　　由依将满月的外表变成了十六岁的少女，这样她才够资格参加歌唱大赛。没想到，满月以“FULLMOON”的艺名一举获得成功，而在此过程中，拓人对满月的感情也渐渐变得复杂起来。英知的归来让拓人颇受打击，而拓人遗失已久的记忆也将成为威胁到拓人生死存亡的关键。

本作承接《奥特银河格斗2：巨大阴谋》，讲述奥特英雄们与阿布索留特人之间惊动银河的命运之战。
　　同时新的奥特战士——雷古洛思奥特曼和阿布索留特人的战士——迪亚波罗亦将登场。

　　战国时代──以恐怖来统治天下最凶最恶的武将“牙鬼幻月”。由“伊贺崎家”率领的一群忍者，经过激烈的战斗，打倒了“牙鬼幻月”。 但“牙鬼幻月”却留下了不详的预言… “444年后，我将变成妖怪复活再次以恐怖支配天下！”时光流逝—— 终结忍者“伊贺崎好天”跟复活的妖怪“牙鬼幻月”决斗，并成功将它封印。时光再次流逝到了现代──“牙鬼幻月”的封印被解除， “牙鬼幻月”的怨念生出了一批妖怪，这些妖怪们组成“牙鬼军团”， 为了让“牙鬼幻月”完全复活，妖怪们到处搜集人们的恐惧心，开始向人们展开袭击！紧急时刻，出现了5个年轻人。 他们正是伊贺崎家的末裔，也就是终结忍者・伊贺崎好天的孙子们！“当忍则忍，可不忍则不忍！” 三代同堂，用火热的“忍者心”（Nintality）以及各种异想天开的忍术来漂亮的击退妖怪！为了继承祖父的“终结忍者”这个封号，也为了阻止妖怪军团让“牙鬼幻月”复活， 他们不仅不忍，还要大肆反击！