U. C.0097时期,“拉普拉斯事变”的纷争终结后,2架独角兽高达被秘密封印,新吉翁残党“袖章”也随之瓦解。就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时,失踪两年的独角兽三号机“凤凰”突然现身,拥有颠覆世界秩序力量的它即刻引发了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方势力的争夺狩猎,一场宇宙对决也即将拉开帷幕......
故事讲述了在L.C.922年,人们正在面对空前的危机。在神话世界的百年战争终结后,败下阵来的魔神们为了在地上寻求新的安居之处,向人类世界袭来。背负着守护街区宿命的警察特殊机关ALCA,旗下年轻的定理者们被强制与拥有特殊能力的异世界女神们合体,进而投身战场之中。
马上就要升为初中二年级的未来,在春假的夜晚发现天空中有神秘的物体掉到了附近的公园。”会不会是魔法师呢?“满心期待的未来,第二天一边欢欣雀跃,一边带着心爱的小熊去了公园。她发现骑着扫把浮在空中,自称里子的女孩,是个魔法师!里子声称是为了找寻物品而来到未来的世界的。而面对突然出现的邪恶魔法师,二人的挂件发出光芒,变身为传说中的光之美少女!