故事发生在遥远的月球之上，彼时，那里已经变成了适宜人类居住的星球。某日，来月球旅行的遥大地（松冈洋子 配音）邂逅了名为“兔人”的月球种族，他们告诉遥大地，他们位于月球内层的星球遭到了邪动族的侵略都和霸占，为此，他们踏上了寻找能够对抗邪动族的勇士的旅程。
　　让兔人们没有想到的是，遥大地竟然就是他们要找的光明魔动战士，通过魔法阵，遥大地召唤出了地之魔动王。之后，召唤出风之魔动王的山本加斯（松田辰也 配音），召唤出水之魔动王的玛利乌斯（安达忍 配音）等人纷纷登场，一行人来到了圣地路那，准备在那里展开一段惊心动魄的奇幻旅程。

　　面包是一款老少皆宜的美食，在某些国家，人们甚至将面包作为每日的主食。在这世上，有英式面包，有法式长棍，有德式全麦，但却偏偏没有所谓的日式面包，对于身为纯正日本人的少年东和马（小林由美子 配音）来说，这不能不算是一种遗憾。因此，从小就对面包有着深厚感情的东和马决定走上面包的修罗之路，发誓要制作出能够代表日本的面包，让日式面包称霸全球。
　　东和马的秘密武器是一双比常人温度略高的手掌，人称“太阳之手”，经过这双手揉制发酵的面团总是能够为食客带来惊喜。在修炼的途中，东和马结识了热血青年河内恭介（阪口周平 配音）和面包店老板的女儿梓川月乃（大冢千寻 配音）。在三人的努力之下，他们在世界范围内的各大面包大赛中崭露头角，逐渐的朝向梦想的终点前进着。

　　宇宙世紀(U.C.)0093年，成為新吉恩總帥的夏亚·阿兹纳布尔對於依然被地球重力所束縛的人類靈魂感到絕望，決心以激烈的手段加以肅正。查知此事的地球聯邦軍王牌駕駛阿姆罗·雷與其所屬的朗德·贝尔艦隊一起與夏亚所領導的新吉恩軍展開最後的決戰...

　　拥有一头青色头发的男主角名字将叫作深井 青(フカイ·アオ，这名字在日语中带有“深青”的意义），是一名13岁少年。青的父亲兰顿·萨斯顿(Renton Thurston、レントン·サーストン)行踪不明，而母亲优莱卡(Eureka、エウレカ)也在10年前被美军带走了。由于继承了母亲的特殊基因，使得他能够看见人眼所不能看到的东西，如粒径为20nm大小的光粒子，红外线、紫外线等等（但在外太空这一特殊生理受到限制）。小时与诊疗所里的老医生深井 敏夫一同生活，现正在Generation Blue（蓝色世代）中。
　　女主角的名字将是阿拉塔·娜露，同样是13岁，是与青一同成长的青梅竹马。娜露因为童年时的事故而使拥有”ユタ”的力量(犹达，是日本冲绳以占卜为职业的灵媒师的名称)的眼睛醒觉。娜露有能够听懂珊瑚岩心声的特异功能，这是因为珊瑚岩的一部分在她体内成长，从某种程度上来说她和珊瑚岩存在部分融合，但正是因为这样，导致她自小身体虚弱，需要把氧气放入在手上的吸氧器，现与父亲、妹妹及祖母一同生活中。
　　本作的舞台也设定在冲绳的磐户岛上，当时的磐户岛正进行著自治权回复运动，但在某一天，在岛上出现的珊瑚岩受到了宿敌白细胞G-Monster的攻击，而为了保护磐户岛，男主角青与人型IFO（Intelligent Flying Object）相遇，并与G-Monster战斗的故事就此展开。

　　故事发生在齐东高中内，这看似是一间再普通不过的学校，可实际上，在校园里徘徊着七只幽灵，流传着七段非常恐怖的灵异传说。为了维持学校的正常运营，校董成立了圣徒会。北城遥都（有马克明 配音）是一个做梦都想过普通人生活的男生，但命运偏偏不放过他，他被校董任命成为了圣徒会的会长。
　　除了北城遥都外，圣徒会的会员还有拥有极强灵感力的恋童癖巫女朝比奈睦月（仲间由纪惠 配音）和拥有附灵体质的和尚之子南堂和御（古本新之辅 配音）。他们所要应对的除了花子、二宫尊德、红斗篷假面等普通的幽灵外，还有一个隐藏的BOSS。

平成元年四月，辽西中学学生日高一平与对手（同时也是其好友）黑木凯争夺日本武道大赛冠军。比赛正进行到白热化之时，二人被一阵白光包围，同时消失。待一平醒来，发现自己来到一片完全陌生的世界——天空界。时破坏神湿华蠢蠢欲动，为保护祥和安宁的天空界，调和神惠明大师将一平和阿凯召来，转生“修罗王”和“夜叉王”，集齐勇猛正直的八部众。然转生过程中，阿凯被湿华迷惑心智，性情大变，成为天界的敌人。天界总司令因陀罗伺机将惠明大师石化，龙王良马、迦楼罗王利加、天王乔加、修罗王一平得知真相逃出，随后与同为八部众的闼婆王高也、紧那罗王莲伽、摩呼罗迦王阿达、夜叉王阿凯展开连番厮杀。八部众的内斗，无意中掉入破坏神的圈套之中……

　　从五次元而来的邪恶军团“嘉克帝国”开始准备进攻地球了。而阻挡他们的是从古代开始就保护地球的艾鲁多兰和他所驾驶的雷神王。可是，雷神王被帝国的司令官贝路塞夫卑鄙的手段所伤，而坠落到地球……
　　雷神王坠落到阳升学园里，艾鲁多兰将操纵雷神王的雷神金属托付给5年3班的学生后逝去……就这样，只有小学生参加的「地球防卫组织」成立。
　　第二天，嘉克帝国的机器人废气邪恶兽·艾提索斯出现。这时，学生们手中的雷神金属闪耀出光芒，当白鸟玛丽亚将雷神金属放到课桌上时，教室变成了司令部。三位学生日向仁、月城飞鸟和星山吼儿成为了剑王、凤凰和兽王的驾驶员，出击迎战“嘉克帝国”的邪恶兽。
　　在战斗中，小岛勉发现三台机器人可以合体，三人最后合体成雷神王，成功地打倒了邪恶兽。
　　就这样，小学生组成的「地球防卫组织」和邪恶的嘉克帝国的战斗开始了……
　　（日文官方介绍）
　　五次元から悪の軍団ジャーク帝国が地球に攻めてきた。その前へ、地球から飛び出した光が立ちはだかる。古代より地球を守ってきたエルドランが操る、ライジンオーである。しかし、帝国の司令官ベルゼブの卑劣な攻撃によって傷を負ってしまい、地球に落下してしまう。そして、帝国の秘密兵器、アークダーマが大量にばらまかれてしまった。その頃、陽昇学園５年３組は居残り授業の真っ最中。そこへ落ちてゆく。エルドランは生徒たちにライジンメダルを託し、地球防衛を頼んで消える。かくして、小学生だけの「地球防衛組」が誕生した。翌日アークダーマは、排気ガス邪悪獣・エキゾーストを生み出した。そのとき、生徒たちのメダルが輝きだす。白鳥マリアがメダルを机に押し込むと、教室がみるみる司令室に変形した。そして、日向仁は剣王、月城飛鳥は鳳凰、星山吼児は獣王のパイロットになる。やがて、小島勉が３体は合体可能であることを発見。ライジンオーに合体し、邪悪獣を倒したのであった。

　　机械化帝国是一个不重视生命的机械帝国，首领是机械神，以攻占星球并把其机械化为已任。而除了地球，包括月球在内，整个太阳系已被机械化了。
　　峰崎拳一，立花浩美和朝冈忍子春风校园六年级生。就在他们回校参加开业礼时，机械化帝国的第一机械王齿车王开始攻击地球。就在峰崎拳一等人快要受袭，守卫地球的艾度兰打开一个时空裂缝，三人回到六千四百万年前的世界。这时光之人艾度兰已经差不多耗尽所有能量，于是他把三只恐龙型机械交给他们。
　　这次保护地球对抗机械化帝国的重任，就落在春风校园六年二组身上了。
　　由于齿车王多次失败，失去机械神的信任，最后一战更被新机械王电气王所杀。电气王乘坐机械神所给予的黑色战神对抗哥修罗，强调力量的他，经常利用军事武器变成机械兽，在某次战役受重伤，与黑色战神同化，但最后也战死。
　　机械神派出的第三个机械王引擎王，矢志以寻找最强力量为己任。但最后一刻，因企图反叛机械神而连累自己的机械儿子乔他宝。亦因挡着自爆的机械城被哥修罗刺穿身体而壮烈牺牲。
　　由于机械城大爆炸，引出时空洞穴，令时序大变，地球变成机械化，所以众人回到过去。原来当初机械化帝国第一个派去地球的原子王在艾度兰的攻击下节节败退，在将被消灭的时候拾得乔他宝的头(被卷入时空洞)。因乔他宝的头收藏了哥修罗的大量资料，故原子王依照这些资料制造一部黑暗哥修罗，使艾度兰反胜为败。最后众人消灭原子王，使时序回复正常，同时他们也见证恐龙灭亡的定律。
　　机械神由于连续失去多个机械王，故以大量能量，使四大机械王复活，并给予他们无限能量，可以自由巨大化，被击败也可复活，也可以自由合体。但在他们多次失败之后，机械神把他们杀死，并亲自到达地球与哥修罗作最后决战。
　　学生们发明了反机械化装置，以哥修罗的能量把地球以及各被机械化的星球回复正常，使情势逆转，最后更一举消灭机械神，令机械化帝国被消灭。

　　为了在新生欢迎会上表演话剧《西游记》，大雄班级举行的话剧的排练。大雄（小原乃梨子 配音）想当孙悟空，可是却只是村人甲。为了证明自己最像孙悟空，大雄用航时机来到中国唐朝，想见孙悟空，而且真的见到了“孙悟空”。后来大雄以哆啦A梦（大山信代 配音）的道具为赌注，证明孙悟空很像 大雄。大雄与他的朋友来到唐朝，却没有见到孙悟空。因此大雄用哆啦A梦的模拟游戏机假扮孙悟空，最后被识破。由于没有关好机器，游戏里的妖怪从游戏机里跑了出来。妖怪最后统治了世界，大雄他们也面临危险。 为了恢复历史，拯救玄奘法师，大雄、静香（野村道子 配音）、小夫（肝付兼太 配音）和刚田武（立壁和也 配音）假扮孙悟空等角色来保护玄奘法师，踏上了冒险之旅……
　　故事改编自小说《西游记》。

　　炎炎夏日，为了找到所向披靡的独角仙，大雄（大原めぐみ 配音）痛哭流涕，对哆拉A梦（水田わさび 配音）软磨硬泡。无奈之下，哆拉A梦和哆拉美（千秋 配音）拿出时光圈，帮大雄在500年前的新西兰寻找独角仙，谁知却意外抓到了早已灭绝的恐鸟。为了不至于让恐鸟走向灭亡，他们决定将其送往奇迹之岛。奇迹之岛是由未来的科学家开发的专门用来收留、保护、研究灭绝动物的小岛，传说岛上有一只黄金独角仙，它可为当地的生物注入生命的力量。一波三折，大雄和小伙伴们来到了这里，并且结识了和大雄极其相像的神秘少年达凯（野沢雅子 配音）以及善良的洛科洛族。与此同时，一个黑心商人图谋抓住黄金独角仙……
　　本片为哆拉A梦诞生前100年的纪念之作。