小行星撞击地球，主要大地受到名为「忍」（シノビ）的毒害，形成异形攻击人类，人们只能逃向以前是海底的「海陆」；拯救的方法唯有复活「机神将」（机神将（ギガロード））。约五百年后，亡国「伊势」的公主巫女雨、与拥有人间兵器「柳生」（ヤギュウ）之血的少年周防二人挺身而出……

　　《境界的彼方》TV未放送特别篇，全1话，将随BD/DVD第7卷于2014年7月2日发售。同时，该卷音像制品中也会包含小剧场《境界的彼方：偶像裁判 ~迷茫依旧的审判之民~》的未放映特别篇，共2集。