许多年前,宇宙最大魔王弗利萨(中尾隆圣 配音)接连败在超级赛亚人之手,他的残党欲孽则流浪宇宙之中寻找那美克星人的新定居点,以期将弗利萨再度复活。几经周折,军队代理索尔贝(斋藤志郎 配音)利用地球的龙珠把弗利萨带回人间,而这个刚刚复活不久的魔王很快展开了他的复仇计划。半年之后,浩浩荡荡的弗利萨大军降临地球,悟饭(野泽雅子 配音)、比克大魔王(古川登志夫 配音)、克林、天津饭、武天老师挺身而出,而孙悟空(野泽雅子 配音)和贝吉塔(堀川亮 配音)则正跟随维斯(森田成一 配音)在遥远的宇宙深处接受试炼。
危机时刻,地球被入侵的消息终于传到维斯和比鲁斯那里,悟空、贝吉塔即将与他们宿命中的冤家再度展开对决……
在樱花烂漫的季节里,无忧无虑的草帽海贼团尽情享受快乐时光。途中乔巴救上了一个魁梧健硕的家伙,最引人注目的是他的右腕装配了用海楼石做成的机械手腕,凡是触碰过手腕的人均能力尽失。原来此人便是曾经培养出无数优秀弟子的原海军大将Z(大冢芳忠 配音)。苏醒后的Z得知路飞(田中真弓 配音)等人的身份后反目成仇,与随后赶来的下属艾伊(筱原凉子 配音)和宾兹(香川照之 配音)对草帽海贼团予以残酷无情的重创。原来Z因某件往事而对海贼极度憎恨,此时他正酝酿一项恐怖计划,势要带领“NEO海军”将新世界的海贼一举歼灭。他的行动引起海军本部的忌惮,而惨败的路飞等人也将向这个前所未有的敌人展开新的挑战……
本片为同名漫画改编的剧场版动画,原著作者尾田荣一郎担任制作总指挥,艾薇儿演唱主题歌《How You Remind Me》和《Bad Reputation》。