在星奏学院里,学生被分为两类,一类是就读于普通科的平凡学生,另一类是就读于音乐科的能够看见音乐精灵的演奏天才。在一次偶然中,普通科的日野香穗子(高木礼子 配音)撞见了音乐精灵莉莉(水桥香织 配音)。莉莉赠予了完全不同音律的香穗子一把魔法小提琴,只要和小提琴心意相通,就算是完全没有经验的初学者也可以演奏出美妙的旋律。
凭借着魔法小提琴,香穗子被选中参加了学校的音乐演奏会。这突如其来的新人遭到了许多学生的妒忌和算计,但香穗子也因此结识了一帮热爱音乐的良师益友。冷酷毒舌的月森莲(谷山纪章 配音),沉默温柔的志水桂一(福山润 配音),开朗率真的土浦梁太郎(伊藤健太郎 配音),双重性格的柚木梓马(岸尾大辅 配音),在和这些天才们相处的过程中,香穗子发现,自己对于音乐的心意渐渐的发生了变化。
学校里的音乐大赛结束了。可是日野香穗子仍然一如既往地进行着小提琴的练习。她再次对自己与其它参赛选手之间的实力差距有了认识,但仍然抱着喜欢小提琴的心情全心投入地继续努力着。可是此时有一个看到她练习时样子的少年卫藤桐也,却对她的努力报以冷淡的语言。而且随着星奏学院下一任理长吉罗晓彦的登场,发生了更加令人震惊的事件!在这种情形下,香穗子的面前又出现了一个神秘的转学生加地葵……