為了與犯罪組織古萊姆(クライム)對抗,國際科學特搜隊的鯨井大助決定組織一隊改造人部隊,最後他找到接受手術的四人,分別是:櫻井五郎、東竜、嘉琳·水木(カレン水木)及大地文太。四人背負著改造人失去肉體的痛苦,與古萊姆周旋。
後來因古萊姆引入了侵略機械人,把目標由犯罪轉變成征服地球。因此皇牌突擊隊亦加入了行動隊長Big 1(ビッグワン),令戰況更加白熱化。
由于两位假面骑士的活跃,邪恶组织·杰鲁修卡被消灭,但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动,而受到该邪恶组织的追杀,之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造,但二人知道改造人的悲哀,而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机,志郎舍命相救,被机关所伤而奄奄一息,为了救他一命,1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。