成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。

小新在河边无意间捡到一颗弹珠，看它很闪亮于是就捡回家里。没想到却被小葵吞进肚子里。这下糟了，原来这颗弹珠是珠由良族与珠黄泉族在争夺的魔人贾克的珠珠，珠黄泉族的首领玉王想要利用贾克的魔力征服世界。就这样，小新一家人卷入两族人的争夺战中，小葵被玉王绑架走了，大家为了保护小葵，费尽心力…最后平安的救出小葵，小新却在无意间，将两颗珠珠放进封印贾克的人俑里，魔人贾克被释放出来了......

　　《新世纪福音战士》电影版第1部。分为“DEATH篇（死亡篇）”与“REBIRTH篇（新生篇）”两个部分。“死亡篇”以原TV版动画第1集到第24集的内容为基础，重新剪辑了一个总结篇。“新生篇”内容承接第24集内容：                                    
                               　　第十七使徒被消灭后，SEELE向NERV下达命令，要EVA初号机负责执行“人类补完计划”。然而碇元度不认同SEELE的做法，拒绝执行。SEELE认定这是一种叛变的行为，决定把NERV彻底消灭。                                    
                               　　破晓时分，NERV本部突然遭到来自战略自卫队的袭击，他们对NERV的人员进行了惨无人道的大屠杀。为了保护驾驶员，葛城美里命令把精神崩溃的明日香送上二号机，并放在湖底的深处，自已就亲自去救碇真嗣 。但此时的碇真嗣已经处在精神崩溃的边缘。

　　小学生小晴与未婚妈妈维达两个人快乐地住在热带雨林里，过着简单而欢乐的生活。一天，酒醉夜归的维达带回来一个美丽的小女孩，她叫阿布。本以为将更加快乐的生活，却在第二天开始了翻天覆地的改变。小晴发现，昨晚的阿布完全是伪装出来的。实际上，阿布不仅脾气古怪，爱捉弄小晴，并且还有一个什么都能吞噬的胃。而小晴从未谋面的爸爸，似乎也要来到这个热带雨林。充满爆笑与不可思议事件人物的热带雨林，因为阿布的到来，而变得与众不同起来。

　　13岁的少年刘昴星（田中真弓 配音）在料理方面具有极高的天赋，自从母亲去世后，他和姐姐合力经营菊下楼，过着平静自在的生活。然而一个不速之客打破了这一切，母亲的徒弟绍安意图霸占酒楼，经过一番料理对决，阿昴凭借高超的厨艺和对饮食的理解打败了绍安，也因此得到李提督（小杉十郎太 配音）的赏识。在此之后，阿昴前往广州，拜在阳泉楼掌厨及第的门下修炼，为了取得特级厨师的资格经历了各种各样的考验。在此期间，他和师兄阿Q逐渐成为并肩作战的好朋友，还共同参加竞争激烈的料理大战，日后更和恐怖的暗黑料理界展开对决……
　　本片根据日本漫画家小川悦司的同名作品《中华一番！》改编。

　　本片由三段互无关联的故事组成。《她的回忆》：2092年，由伊瓦诺夫领导的太空垃圾回收飞船在返航途中接收到来自“宇宙坟场”的求救信号，特殊的是，信号中掺杂着歌剧《蝴蝶夫人》的唱段。队员汉兹与米格尔前往施救，却进入了一位歌剧演员艾娃的回忆，这些栩栩如生的回忆场景对船员们产生了威胁；《最臭兵器》：供职于制药公司的小职员田中信男拖着病体赶回公司，无意中服用了公司与军方合作的实验药品。自此信男成为了制造致命臭气的肉身工厂，对此毫不自知的信男却按照上司命令将药品样本送往东京总部，一路上引起大面积恐慌，军方不得不派出大批军队半路截杀信男；《大炮之街》：在一座由蒸汽驱动的城市中，一家三口展开了一天的生活。母亲去制造炮弹的工厂上班，父亲在炮台担任装填手，小儿子在学校里学习与大炮相关的知识。炮台不停开炮，但敌人的身影却始终没有出现……

　　松井贵博（山口胜平 配音）第一次看到冢本裕司（古泽彻 配音）是在游泳比赛中，天真的松井立刻就被裕司帅气的身姿所吸引从而深深迷恋上了他。可是松井不知道的是，在裕司健康爽朗的外表下，藏着一颗由于被压迫和控制而变得扭曲乖僻的心灵。想要和裕司套近乎的松井成为了裕司一伙狐朋狗友们的玩物。终于，悲剧发生了，在一个雨夜，裕司一帮人残忍的凌辱了松井后消失得无影无踪。
　　许多年过去了，升上高中的松井一直将伤痛深藏在心底，他并不恨裕司，正相反，为了追随他的脚步，松井加入了游泳部。没想到，裕司的身影居然出现在了第一次到社团报道的松井的面前。好不容易逃脱的鱼又回到了网中，裕司和松井，这两人将会怎样面对自己内心深处的黑暗面呢？

平凡的中学生鹿目圆（悠木碧 配音）有一个美满的家庭，在生活中她是个性格温顺又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和 配音）的出现打破了小圆平静的生活，这个性格酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇出现了，小圆在路边救下了一只浑身是伤的奇怪动物 ，没想到这只动物居然会说人类的语言。它告诉小圆它的名字叫丘比（加藤英美里 配音），并且提出了一个特殊的要求，它希望小圆能够和它签订契约成为魔法少女。

　　东京大街上的一角，某栋高楼的顶层废弃小屋中。町屋翔太正在制作梦想中的火炬，而他的朋友绫瀬明日奈的父亲的尸体，出现在了这座大厦。警察的调查没有什么结果。但第2天一位白发少女给翔太送来了明日奈的父亲写给翔太的“死后文”——死去的人留给生者世界的信息。而送信来的少女，自称文歌。死后文的内容是什么？是对尘世的思念，还是对生者的嘱咐？一封封“死后文”，引出了一段段人间悲剧。而送信少女文歌，似乎也隐藏着不可告人的秘密。

突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成...