人类文明进入动乱的时代，地球笼罩在战火之下，各大主要城市相继沦陷，人类四散而逃，血流成河。虽然星野铁郎（野沢雅子 配音）破坏了机械化星球，但是机器人与人类的战争仍在继续，并且人类已经到了生死存亡的危急时刻。正值紧要关头，铁郎得到来自梅蒂尔（池田昌子 配音）的信息，要他重新搭乘银河铁道999号。在一众战友的帮助下，铁郎穿过一道道火线，经过几番周折，终于登上了久违的银河铁道999号，重新开始了一段漫长、孤独而又充满惊险的宇宙旅程……
　　本片为《银河铁道999》第二部剧场版动画。

　　神様の手違いで死んでしまった主人公は、異世界で第2の人生をスタートさせる。彼にあるのは神様から底上げしてもらった身体と、異世界でも使用可能にしてもらったスマートフォン。様々な人達と出会い、大切な仲間を得ていく中で、いつしか主人公はこの世界の秘密を知る。古代文明の遺産を受け継ぎ、お気楽な世界の王たちと力を合わせながら、彼はのほほんと世界を巡っていく――

　　帝国历486年，年仅19岁的茵哈特·冯·缪杰尔凭借其天才的指挥能力和战斗素养赢得无上荣耀，但同时因为姐姐安妮罗杰是皇帝的宠妃，他也受多许多贵族军官的嘲讽和轻蔑。当茵哈特在上将齐格飞·吉尔菲艾斯的陪同下率领远征军抵达曾经牺牲了数千万人命的伊谢尔伦要塞时，却 被指挥官不顾舟车劳顿，下令命他们前往奈古尼查星迎击同盟军。 在这颗情况复杂的星球，茵哈特再次展现了他出神入化的战场应变能力。五成兵力惨遭歼灭的同盟军指挥官丝毫不承认自己的颟顸，反而率领大批兵力卷土重来。 帝国历486年9月（宇宙历795年9月）第四次提亚马会战拉开序幕，莱因哈特上将率领作为核心的帝国军左翼舰队，即将迎来一场名载史册的传奇战役……

　　描写的是从宇宙历七九五年、帝国历四八六年十月的第三次迪亚马特会战到宇宙历七九六年、帝国历四八七年二月的亚斯提会战之间的情节。帝国军的年轻上将莱因哈特和同盟军的不败英雄杨威利在片中初次显示了他们的实力。它的配乐采用了交响乐来衬托其气势，舰队对战时声势甚为浩大。                                    
                               　　片中还穿插了杨、拉普和洁西卡的三角关系。除此以外，基本上是正传的1、2集的重复与补充。                         

　　苍月潮（畠中祐 配音）是一位身体瘦弱的平凡国中生，一次偶然中，潮在地下室里遇见了一只被封印长达五百年之久的妖怪，并于无意之中拔出了封印它的“兽茅”，使得妖怪重返人间。潮身上所爆发出来的惊人力量令妖怪震惊，它当即表示臣服于潮，于是，潮替妖怪取名“虎”（小山力也 配音）。
　　成为了兽茅的继承人，潮的肩上负担起了斩妖除魔维护和平的使命，各路妖怪亦循迹而来，向他发出了挑战。在不断的合作和战斗之中，潮和虎之间结下了深厚的友谊，而两人亦被卷入了一个波及到整个世界的阴谋之中，而躲在兽茅背后的各路人马也一一出现在潮的身边。

十鬼蛇王马走进了用凶暴的斗技者对打来解决公司纠纷的地下世界。别管钱了，他只想拼命战斗，取得胜利。