大雄最近一段时间经常被奇怪的梦困扰，接着，他房间中央的榻榻米下面还不断出现响动。某天，榻榻米被撞开，里面跑出一个像兔子一样的生物。它的名字叫恰米，是外星男孩罗布姆的宠物。罗布姆和亲人、朋友生活在名为可亚可亚的星球，这里盛产奇妙的浮游矿石。邪恶的浮游矿石工业公司为了霸占这些矿藏，不惜使用各种卑鄙手段企图将罗布姆这群早期开拓者赶走。罗布姆乘坐的飞船就是遭到浮游矿石工业的袭击，偶然引发错乱和大雄的房间连在了一起。
　　哆啦A梦和大雄修好了罗布姆的飞船，还和可亚可亚星的人民成为好朋友。与此同时，浮游矿石工业继续他们罪恶的计划，善良正直的大雄决心帮助外星朋友守卫他们的家园……

　　大雄在学校的后山捡到一株被人抛弃的树苗，通过哆啦A梦的植物自由化生长叶，树苗一夜之间变成了蹦蹦跳跳的小家伙，大雄为其取名木木。木木聪明伶俐，热爱学习，不仅得到了野比家所有人的喜爱，也成为胖虎、小夫、静香他们的好朋友。某天，小伙伴们去后山玩耍，结果被吸入到外星飞船之中。由于人类对地球生态环境的破坏日趋严重，一群具有高智慧的植物宇宙人决定将地球上的植物劫持，以挽救它们濒临灭绝的命运。然而，失去植物，地球上的氧气将会减少，人类乃至所有动物都将灭亡。大雄他们能否阻止宇宙人的计划？
　　本片根据日本漫画家藤子不二雄的原作改编。

　　1969年，著名日本漫画家藤子·F·不二雄（藤本弘）创作出圆脑袋、蓝身体、拥有神奇道具的百宝袋的哆啦A梦，在此之后，这个可爱的角色迅速窜红，享誉海内外，成为最成功的漫画角色之一。随着1979年同名动画开播，哆啦A梦更走入千家万户，带给所有的拥趸无数甜蜜美好的回忆。即使藤本弘老师去世后，哆啦A梦也并未停止他前进的脚步，他和大雄、静香、小夫、胖虎等好友继续引领着大朋友、小朋友们，开始一次又一次的全新冒险。
　　2005年，TV动画版《哆啦A梦》第二作在中止一个月左右后重返荧屏，而与后期剧场版相呼应的全新且更贴近原著的画风则仿佛昭示着一个新时代的到来。毕竟我们最熟悉的朋友从未远去，他以更纯真的面孔回到我们的身边！

　　一天，大雄和静儿、技安被强夫邀到家中参观恐龙化石。当然，大雄免不了又被强夫取笑一番。为了要做强夫面前争一口气，大雄夸下海口，恐龙化石没什么了不起，他要让小伙伴们见识一下真正的恐龙！
　　奇迹再次发生在大雄身上，他真的找到了一颗活的恐龙蛋！大雄和叮当在家将小恐龙孵化了出来并在公园里暗中饲养。小恐龙比助一天天长大，公园有怪兽的消息传遍了日本。为了小恐龙能健康成长，大家决定将小恐龙用时光机送回白垩纪。
　　没料到，一个神秘人暗中跟踪他们，也来到了白垩纪想要虏走比助。为了保护比助，叮当、大雄、强夫、技安和静儿再次来到了白垩纪……

　　小夫的炫耀一如既往让大雄气愤不已，为了帮大雄实现潜水的心愿，哆啦A梦将整个城市变成了虚拟海洋，并利用道具引来了海洋中的生物。一个美人鱼来到了城市里，却阴差阳错被困了下来。她名叫苏菲亚，是人鱼一族的公主。据说，人鱼族在五千年前生活在另一颗星球，爱好和平的他们因受到另一族的侵略而来至地球避难，从此在这里扎根。大雄、静香他们很快和苏菲亚成为好朋友，并答应帮她寻找人鱼族传说的宝物“人鱼之剑”。正当小伙伴们在深海中尽情玩耍之时，危险不期而至。当初侵略了人鱼族家乡的外星恶魔也来到地球寻找人鱼之剑，小伙伴们即将展开新的冒险……
　　本片为哆啦A梦剧场版开播30周年纪念作品。

　　故事主要回忆太阳系内部战士以及Sailor Moon的觉醒背景。

　　深夜三时正，睡梦中的小朋友被一阵笛声吸引，起来走到屋外，边唱著"三时之妖精"，边循笛声来到飞船上，待船上载满小朋友后，吹笛的妖精便把飞船驶向天上。
　　一日，内部战士们聚集在真琴家中，学弄曲奇饼。三时了，真琴家中的报时钟响起，一只小鸟弹出叫了三下，真琴於是对众人说起三时之妖精的故事。
　　豆钉兔拿著她弄的曲奇走到街上，遇到一位美少年。二人谈得很投契，互相自我介绍，那位美少年名叫贝鲁鲁(Peruru)。阿兔也拿著她弄的曲奇去找阿卫，她见到阿卫穿著一件她没见过的衬衫，追问之下，知道是阿卫和豆钉兔一起买的，醋意大起。豆钉兔把她的曲奇送给贝鲁鲁，贝鲁鲁开心的收下，二人挥手道别。
　　深夜，一阵笛声响起，豆钉兔神情怪异的走了出去。戴安娜叫醒阿兔，阿兔跟著豆钉兔看个究竟。在街上，阿兔遇到出来查看的内部战士，一起去追豆钉兔。她们把豆钉兔打醒之后，想阻止其他小孩上飞船，吹笛少年拿出许多魔法糖，变成妖魔胖宝宝(BonBonBaddies)，攻击众人。所有人都变身了，战斗中，吹笛少年再用魔法把四周变成花园，花园中有一间糖果屋。战士们被迷惑了，入了糖果屋后，都变成了小孩。突然一枝红玫瑰打落了笛子，战士们才回复清醒。吹笛少年令小孩子们捉住礼服面侠，众战士处境危险。贝鲁鲁突然出现阻止战斗，原来他和吹笛少年是兄弟。不久神秘女声叫吹笛少年Pupuran，船头出现了巴彼安女王(Lady Vadiane)的影像，贝鲁鲁对她说不再相信她，女王认为是SuperSailorChibimoon迷惑了贝鲁鲁，於是命Pupuran把她和其他小孩捉走。
　　载著SuperSailorChibimoon的飞船和另外两艘飞船相遇，一起降落在一座空中城堡上。
　　SuperSailorChibimoon见到女王，女王的野心是要梦想黑洞吞噬整个地球，SuperSailorChibimoon坚定地说她的奸计不会得逞，因为地球有Sailormoon。
　　把阿卫送回家休息之后，战士们在贝鲁鲁的带领下，坐上飞船朝梦想黑洞总部甜面包城堡进发。终於来到城堡外，飞船突然被一团火光袭击。城堡内的妖精们发炮攻击，被SuperSailorMercury的必杀技克制住，飞船降落。妖精们利用胖宝宝攻击，面对数量庞大的胖宝宝，五人后退无路。突然外部三战士出现救了她们。深海镜照出了妖精们手上的笛子是关键，於是集中攻击，妖精们变成鸟儿飞走了。
　　战士们来到身形巨大的巴彼安女王面前，她们的脚下出现了许多梦棺，小孩子们就睡在里面。
　　SuperSailorChibimoon在女王的手上现身，在女王的压力下解除变身。梦想的黑洞出来了，所有人的攻击都无效。女王捉住豆钉兔飞向黑洞，贝鲁鲁和SuperSailormoon追去，其他战士想帮忙却被打伤，并开始解除变身。SuperSailormoon只身飞向黑洞，终於被她找到豆钉兔，但周围的环境却变成了阿卫的房间。她们碰见阿卫，SuperSailormoon从他的奇怪言行中，知道他只是幻觉，她们於是冲破了梦棺的封锁。SuperSailormoon的心口针发出强光，使其他战士们能回复变身。女王的攻击烧伤了SuperSailormoon，SuperSailormoon得其他战士们集合力量，把力量从她的心口针传到豆钉兔的心口针，豆钉兔回复变身并醒过来。二人手拖手，拿著权杖，一同攻击巴彼安女王...