表面上看来,桃子(冰上恭子 配音)、百合(野上尤加奈 配音)、雏菊(宫村优子 配音)和红花(今井由香 配音)是四个活泼可爱个性开朗的女孩,可是在背地里,她们还有这另一重身份——为了拯救天使界而战斗的“爱天使”。随着时间的推移,曾经激烈的战斗已经成为了过往,过上了平静生活的四人逐渐失去了作为“爱天使”的记忆。
一次旅途中,前往海边度假的四人意外的遭到了妖怪的袭击,之后现身的阿布罗狄女神(病藤真子 配音)恢复了四人的记忆。一枚神秘戒指的出现令来自魔界的普雷(矢尾一树 配音)再度蠢蠢欲动,而这枚戒指不再别处,正巧就在桃子的手中。
森の民の少年ポポは、平和な森に異変が起きた原因を調べるため旅立った父ペレの帰りを待ちわびていた。しかし森の異変は、ポポの母ピアまで変えてしまう。父ならば、母を助ける手がかりが分かるかもしれない。ポポは父に託されたドングリ型のペンダント「守護者の証」を胸に、父を追って旅立つ。
旅の途中、ポポが持つ「守護者の証」を狙って、森の破滅を願うアダーと手下たちが、赤い目の甲虫を操りポポを襲撃するが、そのたびに何処からともなく巨大なカブトムシ「ムシキング」が現れポポを護るのだった。
1999年,由于数码世界资料异常增生,导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象:东南亚没有下雨,池塘全部干涸;中东却因为连场大雨发生洪水;美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。
11岁的少年八神太一(藤田淑子 配音),和伙伴石田大和(风间勇刀 配音)、武之内空(水谷优子 配音)、泉光子郎(天神有海 配音)、太刀川美美(前田爱 配音)、城户丈(菊池正美 配音)、高石武(小西寛子 配音)一起参加了夏令营,一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里,他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后,八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽,眼看大家都要被抓住的时候,太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽,拯救了他们。进化到底是怎么回事情?数码世界究竟是什么?无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前,精彩的冒险就这样开始了……
在纽约出现了一只神秘的数码兽,他利用自己特殊的力量将太一、阿和、阿空、光子郎、美美、阿丈带到了一个陌生的世界。同时,在纽约的八神光和高石武发现了这只数码兽,并且看到一个美国小孩与数码兽对话之后逃走的情况。巴达兽悄悄地尾随其后,得知这个小孩要去一个叫“花场”的地方寻找“夏天的回忆”。大家赶至那里。 收到小光的电子邮件的大辅他们马上坐飞机来到了美国......
2012年2月,东京铁塔上空出现了巨大的数码蛋。就在本宫大辅(20岁)和V仔兽修行拉面技艺的时候,遇到了虽然拿着有裂纹的数码器,但身边没有搭档数码兽的迷之青年——自称“我没有数码兽,我的搭档数码兽被我杀了,我是世界上最初和数码兽建立搭档关系的人类。”
2012年2月,东京铁塔上空出现了巨大的数码蛋。就在本宫大辅(20岁)和V仔兽修行拉面技艺的时候,遇到了虽然拿着有裂纹的数码器,但身边没有搭档数码兽的迷之青年——自称“我没有数码兽,我的搭档数码兽被我杀了,我是世界上最初和数码兽建立搭档关系的人类。”
2010年,曾经的小学生们已经步入大学,太一、阿和等人步上不同的人生道路(八神太一和石田大和将会成长为22岁),而就在此时,数码宝贝的研究者メノア(松冈茉优 配音)却告诉他们:“被选召的孩子们”长大成人后,数码宝贝也将随之消失…。预告中字幕表明这是“太一他们最后的故事” ,结尾则注明:献给所有和数码宝贝一起成长的“孩子”们,还有亚古兽注视着长大成人的太一的背影,“太一,你长大了呢”。
新世纪之初不久某年的夏天,为了与父亲生活,逢泽步来到了距东京2小时火车车程的小镇。
步是不去上学的中学生。原因不明。似乎和什么样的理由都沾一点边,但又不是那种理由。觉得无论走到哪、无论做什么都无聊的步,来和父亲度过一个夏天,是因为母亲出的主意。双亲在他还小的时候离婚了,他和父亲也4年没有见面了。步并非积极地响应母亲的提案。对毫无朝气的步,妈妈提出要以买个山地自行车为交换条件,让他去和父亲见面。既然话都这么说了,步也不得不打起点精神。
这样步终于到了那个小镇。母亲说步小时曾来过一次,但他一点印象也没有。田菜——在围绕着广阔的水田的山的斜面的,似乎被农家钉子一样点缀着的小盆地。在看见这景象的瞬间,步就后悔来到这里了。因为无论从什么角度怎么看都是不变的田舍,实在是寒酸得要死。
然而,这么想可就大错特错了....
在太一一行人告别数码世界后,数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门,而数码世界的内部却没有太平多少时日,就又开始了纷争。
数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生,没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战,只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅(木内玲子 配音)、井之上京(夏树莉绪 配音)、火田伊织(夏树惠 配音)等人,和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等,还有新的数码宝贝参与。于是,在第一代数码人的带领下,新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……